El Premio CAPES de Tese reconoce los mejores trabajos de tesis de doctorado defendidos en Programas de Postgrado brasileños según los siguientes criterios: originalidad del trabajo, relevancia para el desarrollo científico, tecnológico, cultural, social y de innovación y el valor agregado del sistema educativo al candidato.
Creado en 2005 e impartido por primera vez en 2006, abarca todas las áreas de conocimiento que tienen representante en la evaluación del Postgrado Stricto sensu. Uno de los objetivos de la iniciativa es aumentar la visibilidad de las acciones positivas e inductoras de CAPES en el Postgrado Brasileño.
En 2021, el Programa de Postgrado en Medicina Veterinaria (Clínica y Reproducción Animal) recibió una mención honorífica por un trabajo defendido. La tesis titulada “Eficiencia técnica, calidad embrionaria, proteómica y bienestar animal asociados a la recolección transcervical de embriones en ovinos” (https://app.uff.br/riuff/handle/1/36392) fue defendida por la alumna Juliana Dantas Rodrigues dos Santos, bajo la supervisión del Prof. Dr. Felipe Zandonadi Brandão y co-supervisado por el Dr. Jeferson Ferreira da Fonseca, Investigador de Embrapa Caprinos y Ovinos.